Mindmap-Galerie 蛋白質-2
生化,蛋白質是生物體內一類重要的生物大分子,它們由胺基酸透過肽鍵連接而成,具有複雜的結構和多樣的功能。詳細介紹了蛋白質分子結構、蛋白質理化性質、勝肽等知識點。
蛋白質 生物思維導圖
蛋白質的功能
糖代謝
脂類代謝
酶與酶促反應
生物大分子的結構與功能
文化神經症2
第三章 蛋白質化學
蛋白質的合成
蛋白質的理化性質
蛋白質-2
勝肽
勝肽鍵
存在於蛋白質和勝肽分子中,由一個胺基酸的α-羧基與另一個胺基酸的α-氨基縮合形成的醯胺鍵
勝肽單位
氮單位的孤對電子與C=O鍵的π電子存在P-π共軛效應->可發生共軛
雙鍵之間有一定程度的雙鍵性質,不能自由旋轉
勝肽平面
肽單位的六個原子都在同一平面上
勝肽單位幾乎都是反式結構,構象可進行旋轉
勝肽/胺基酸殘基
分類
2-二肽
2-10-寡肽
10-50-多勝肽
>50-蛋白質
活性勝肽
特殊生理功能的勝肽類物質
在代謝調節、神經傳導、細胞分化、生長發育、免疫防禦、生殖調節、自由基清除&腫瘤發生等方面扮演重要角色
內源性活性勝肽
外源性活性勝肽
食物蛋白【質】有限消化的產物被直接吸收,並參與攝食、消化、代謝、內分泌調節
還原性穀胱甘肽/GSH
谷氨酸 半胱氨酸 甘氨酸-以異肽鍵&肽鍵連接而成的酸性三肽,所含巰基為主要官能基
具有還原性,重要的抗氧化劑
肌肽&鵝肌肽
二勝肽
抗氧化劑,參與清除活性氧
蛋白質分子結構
基本結構
一級結構-胺基酸序列
構成一個蛋白質分子的一條或多條勝肽鏈的全部胺基酸序列,包括可能存在的二硫鍵的位置,但不包括α-碳構型以外的其他空間結構
主要化學鍵—肽鍵/二硫鍵
功能
蛋白質的一級結構為其空間基礎
蛋白質的一級結構相似則功能相似
同源蛋白的一級結構蘊含生物演化訊息
改變蛋白質的一級結構可直接影響其功能
空間構象
二級結構-勝肽段構象-描述主鏈原子局部空間結構
蛋白質局部勝肽段(含3-30個胺基酸殘基)主鏈原子的空間佈局,即主鏈構象,不包括側鏈構象及勝肽段與勝肽段之間的空間佈局
α螺旋
右手螺旋結構
每個螺旋含有3.6個胺基酸殘基,螺距為0.54nm,
胺基酸側鏈伸向螺旋外側,靠氫鍵維繫穩定
β摺疊
蛋白質局部勝肽段的主鏈構象成鋸齒狀折疊
平行結合形成群褶結構-同行平行/反向平行
β轉角
蛋白質分子中用於連接其他二級結構的一種剛性回折肽段
含有四個胺基酸殘基-殘基第二位脯胺酸出現頻率最高,第三位甘胺酸出現頻率最高
圓環
無規捲曲
化學鍵:氫鍵
三級結構-亞基構象-描述所有原子的空間結構
一個蛋白質分子或其一個亞基所含全部原子的空間佈局,不包括它與其他分子或亞基之間的結構關係
化學鍵:疏水作用、離子鍵、氫鍵、范德華力等非共價鍵 二硫鍵等少量共價鍵
肌紅蛋白-在細胞內儲存和運輸氧
核糖核酸酶-水解核糖核酸
基序/模體-由相鄰的兩端或多段相同或不同二級結構片段進一步聚集和結合形成的一種可識別的結構單位
螺旋-環--螺旋-螯合有Ca2 的基序結構
鋅指-螯合有Zn2 的基序結構
結構域-三級結構中由一段勝肽鏈形成的一種結構緊密、獨立、穩定、有特定功能的結構單位
四級結構-四聚體構形-描述亞基之間的相互關係
多亞基蛋白所含全部亞基的數目、種類、空間佈局&亞基之間的相互結合與相互作用,但不包括亞基的三級結構
分類(是否含有四級結構)
單體蛋白
多亞基蛋白
所含亞基數-二聚體、三聚體、四聚體
所含亞基種類-同聚體蛋白、異聚體蛋白
原【聚】體-具有空間對稱性的四級結構中的一種結構單位,可視為同聚體
構象決定功能,變構改變活性
構象分類-球狀蛋白質/纖維狀蛋白質
生理功能—活性蛋白【質】/結構蛋白[質]
變構蛋白與變構效應
協同效應-一個位點與配體結合引起蛋白質構形改變,進而影響到其他位點與各自配體的親和力或結合速度
正協同效應-導致親和力增強、結合加快
負協同效應-導致親和力下降、結合減慢
同促效應一同一配體所產生的綜效
異促效應-不同配體所產生的協同效應
蛋白質理化性質
一般性質
紫外線吸收特徵
所含肽鍵結構對220nm以下紫外線有強烈吸收
所含色氨酸、酪胺酸對280nm紫外線有強烈吸收
顯色反應-茚三酮反應、雙縮脲反應
N端反應
兩性電離與等電點
大分子特性
膠體性質
其穩定因子為同性電荷相斥 水化膜
沉降-蛋白質的顆粒密度比水大,在溶液中有在重力作用下沉降的趨勢
沉降係數
蛋白質變性與復性
許多蛋白質由不只一條肽鏈構成,每一條肽鏈都含有其三級結構,稱為該蛋白質的一個亞基,該類蛋白質稱為多亞基蛋白