心智圖資源庫 DNA的生物合成
細胞生物學DNA的生物合成心智圖,包含DNA複製的概況、原核生物DNA的複製、真核生物DNA複製等。
編輯於2024-04-07 19:55:13DNA的生物合成
DNA複製的概況
研究系統
FX174DNA或質粒DNA構成的體外系統 研究複製所必需的酶,蛋白質及其因子
以E·coli為模式生物 研究原核生物DNA複製
以酵母和動物病毒為模式生物 研究真核生物DNA複製
特點
半保留複製
錯誤少
高效率
高保真性
複製的起點與方向
複製子,起點 複製叉,複製泡
原核生物
只有一個複製起點 多次複製同步進行
真核生物
多個複製起點
原核生物DNA的複製
參與複製的酵素和蛋白質
DNA聚合酶 都不能從頭合成多聚脫氧核苷酸鏈 新鏈的合成都需要先合成一小段RNA引子 才能在此基礎上新增dNTP
DNA聚合酶I pol I
在DNA損傷的修復中扮演重要角色 複製時的作用為切除RNA引物
可催化鏈的延長和水解 具3¢-5¢核酸外切酶活性(校對功能) 具5¢-3¢核酸外切酶活性(切除RNA引子)
小片段 5¢-3¢核酸外切酶活性
大片段 KLenow片段 DNA聚合酶與3¢-5¢核酸外切酶活性
DNA聚合酶II polII
主要參與DNA的損傷修復
DNA聚合酶III polIII
DNA的複製
含三個核心酶,夾子組裝複合物
其他酵素和蛋白質
DNA解旋酶
DNA雙螺旋的解開 具移位酶活性,解鏈具極性
單股結合蛋白 SSB
與DNA單股區域結合
防止DNA重新形成雙股
防止單鏈內二級結構的形成
防止核酸酶對單股區的水解
增強某些酵素的活性(聚合酶)
具正協同效應
拓樸異構酶
清楚正超螺旋 調節超螺旋程度
TopI
轉錄區
TopII
染色質骨架蛋白和核基質 與複製有關
引發酶
合成RNA引子
N端結構域 p12
結合DNA的結構域
C端結構域 p16
與複製叉內DNAB蛋白作用 從而募集到複製叉上
核心結構域 p35
RNA聚合酶活性中心
DNA連接酶
連接切口 需要鎂離子催化
噬菌體和真核細胞 ATP提供能量
細菌 NAD 提供能量
複製的起始
只有一個起點OriC
需要在引發體作用下合成RNA引子
DNA鏈的延伸
前導鏈
後隨鏈 岡崎片段
半不連續複製
複製的終止
單向複製環狀DNA分子複製終點即原點 雙向複製環狀DNA分子在複製叉相遇時完成複製
終止子序列 ter
終點利用物質(Tus)結合ter阻止複製叉移動
真核生物DNA複製
參與真核生物DNA複製的酵素和蛋白質
DNA聚合酶
無切除RNA能力
DNA聚合酶a DNA pol a
合成RNA引子
無校對能力 有複製蛋白(RPA)結合降低錯誤率
DNA聚合酶d和e DNA pol d&e
具備校對能力
增生細胞核抗原 PCNA
輔助蛋白 組成滑動鉗 提高DNA合成連續性
DNA聚合酶b DNA pol b
參與DNA損傷的修復 填補DNA鏈上的小缺口
DNA聚合酶g DNA pol g
位於粒線體基質 負責粒線體DNA的複製和損傷的修復
其他酵素和蛋白質
核糖核酸酶H1和翼式內切核酸酶1(FEN1)
切除RNA引子
複製因子C RFC
夾子組裝器 幫助PCNA安裝到DNA模版上 並與DNA聚合酶結合
真核生物DNA複製的特點
同
為半保留複製
為半不連續複製
需要解旋酶解開雙股,並由SSB與單鏈區結合
需要拓樸異構酶消除解旋形成的扭曲張力
需要RNA引子
對新鏈合成有校對機制
異
原核生物為單一起點複製,複製子較大 真核生物為多起點複製,複製子較小
原核生物複製叉移速900nt/s 真核生物複製叉移速50nt/s
真核細胞DNA聚合酶和蛋白質因子種類較多 引發酵素活性由DNA pol a的兩個小亞基承擔
原核細胞在第一輪複製未結束時可開啟第二輪複製 真核細胞複製有複製許可因子控制,複製週期不可重疊
原核生物DNA為環狀,DNA複製末端不會縮短 真核生物DNA為線形,DNA複製末端縮短問題需端粒酶解決
真核生物DNA複製過程
SV40DNA的複製
酵母DNA的複製
端粒DNA的複製
DNA複製與核小體組裝
DNA複製的其他方式
滾環複製
取代環複製
線形DNA末端複製的方式
DNA複製的高度忠實性
4中dNTP濃度的平衡
DNA pol的高度選擇性
DNA pol的自我校對
使用RNA引子
錯配修復
逆轉錄作用
逆轉錄病毒的結構
cDNA的合成
原病毒DNA的整合
逆轉錄的生物學意義
原核生物DNA複製的調控
細胞內DnaA的濃度
OriC位點甲基化的延遲
真核生物DNA複製的調控
細胞週期層級的調控 限制點調控
染色體層面的調控
複製子層級的調控
DNA的體外合成
聚合酶鍊式反應 PCR