原始複製因子在其複製過程中產生的「錯誤」使「進化」成為可能

穩定性發展的「三」條件

演化中的複製錯誤與高精確度的複製因子分別都成為演化的條件？如何調解其矛盾？

A、T、C和G即是“鹼基”，鹼基合成DNA分子。其中只有一小部分是基因

進行自我複製

間接地監督製造了不同種類的分子—蛋白質

基因控制人體的製造，其影響是單向的，後天獲得的特性無法遺傳

自然選擇有利於能純熟地控制胚胎發育的基因

它具有高度群居性——基因與基因之間相互合作

基因本身能存活很久

染色體的壽命是一代，而遺傳單位“足夠小”，它可能完整複製了“最初”的遺傳單位

先前存在的亞單位透過交換偶然聚合在一起（一般方式）

點突變（少見；遺傳單位越長，它在某點上為突變所改變的可能性就越大）

倒位（少見；一般是災難性的，但可能與“好的遺傳物質”緊密鏈接，形成新的遺傳單位；最好的例子是“擬態現象”）

在基因庫中，「好的」基因是在與等位基因競爭後的勝利者。所以，在基因的層次上講，利他行為必然是壞的，而自私行為必定是好的

有性生殖和染色體交換－性到底有什麼益處？ →基因是「自私」的→如果同無性生殖相對的有性生殖有利於負責有性生殖的基因，這也就是有性生殖現象的充分理由

我們之所以能將這種小的遺傳單位或基因視為最接近基本的、獨立的演化因素，正是性與染​​色體交換的結果

成功基因所具有的另一個普遍特徵是，它們通常把它們的生存機器的死亡至少推遲至生殖之後（祖先是不會在年幼時就喪生的）

基因庫中的晚期活動的致死基因比早期活動的致死基因穩定得多

植物－利用陽光把簡單分子組成複雜分子

動物－吃掉植物或其他動物

動物進化中用來進行快速動作的部件是肌肉

生物計算機的基本單位是神經細胞或所謂的神經元

我們如何控制肌肉收縮的時間和速度

生存機器的行為有一個最突出的特徵，這就是明顯的目的性

基因為了獲得“某種目的”需要去控制“生存機器”，但由於“時滯”的原因，基因無法直接控制“生存機器”，而是藉助控制蛋白質的合成來進行操縱。

由於生存機器面對「數不盡」的「遭遇」需要「及時反應」而生存下來，而基因並沒有這樣快的反應時間，它只能竭盡所能事先部署一切，使之獲得足夠多的未來將會發生的所有「可能性」的規律，並為此提出「忠告」。

預先賦予生存機器以一種學習能力（例如：去做讓你產生「正面情緒」的事，迴避「負面情緒」的事）

模擬－好的模擬肯定遠勝於盲目的試驗和誤差→模擬能力的演化似乎最終導致了主觀意識的產生(因此，生存機器最終從主宰它們的主人即基因那裡解放出來，變成有執行能力的決策者)

若要讓「利他行為」存活下來，操縱該行為的基因必須比操縱其他行為的基因有更大的存活可能性

每一個」行為」的操作都有其操縱的「基因」（蜜蜂實驗中的「揭蓋」與「丟」）。它們聯合起來，才會使得這整個動作有意義，所以這個角度看可以將它們視為一個單一的合作單位，但作為複製因子，它們是兩個自由的、獨立的行為者。

以表面的利他行為促進基因生存的方式—聯絡

（ESS一旦確立，就會穩定下來：偏離ESS的行為將受到自然選擇的懲罰。）

當雙方處於「對稱性」時（競賽參與者除搏鬥策略之外，其餘一切方面的條件都是相等的）

當雙方進入「不對稱」的競賽

1.近親多半共有同樣的基因，而操縱個體對親屬表現利他行為的基因可能因此失去一個拷貝，但同一基因的大量拷貝卻得以保存。

2.如何彌補個體的「自我犧牲」以獲得相等或更大的利益－以平均數計算：一個準備自我犧牲的利他基因=拯救兩個以上的兄弟姊妹（子女或父母）=4個以上的異父異母兄弟姊妹（或叔父、叔父、伯父、伯母、姪子、姪女、祖父母、孫子孫女）=8個以上的第一代堂兄弟姊妹

3.父母之愛為何大於親緣關係－

個體生存機器必須做兩類完全不同的決定－撫養的決定和生育的決定

在演化上最穩定的策略—撫養和生育的各種混合策略

1.動物控制生育是利他性的，為了群體的整體利益而控制生育

2.動物控制生育是自私性的，為了進行繁殖的個體的利益而控制生育

親代投資的定義是：「親代對子代個體進行的任何形式的投資，從而增加了該個體生存的機會（因而得以成功繁殖），但以犧牲親代對子代其他個體進行投資的能力為代價。 」

利他行為投資：我們說個體A對個體B進行投資，意思是個體A增加了個體B的生存機會，但以犧牲個體A對包括其自身在內的其他個體的投資能力為代價，而所付出的一切代價均需以適當的親緣關係指數進行加權計算。

（1）母親的觀點

（2）幼兒的觀點

（體積：卵子＞精子；數量：精子＞卵子）

1）卵子提供食物儲存，而精子不提供，只負責將基因輸送給卵子（因此，父親對子代的投資，比他應支付的資源份額（50%）少）

2）精子能夠大量製造胚子，因此具有繁殖更多幼兒的潛力

*自然選擇有利於製造小的但能主動找到大的並與之融合的性細胞。

1）大量投資或「誠實」策略－卵子

2）小量投資、具有剝削性質的或「狡猾」的策略－精子

1.生育同等數目的兒女的策略是進化穩定策略（偏離此策略的基因都要遭受淨損失）

1）小鳥發出警告聲，通知同伴危險來臨，但其聲音也加大自己的危險

2）瞪羚的跳躍行為－為了證明自己「強大」好讓「掠食者」不以自己為獵殺目標

3）蜜蜂等社會性昆蟲的自殺行為－職蟲都不能生育（職蟲以保護或犧牲自己為代價，利用它們的母親來生產它們自身的基因的拷貝）

1）螞蟻&蚜蟲、地衣從&菌類和綠海藻－這種基本不對稱性能夠導致相互合作的演化穩定策略。

2）我們的每一個基因都是共生單位。我們自己就是龐大的共生基因的群體

1）廣義地說，覓食母以模仿的方式進行自我複製。與基因類比，並非所有基因都善於自我複製，覓食母也是如此。

2）有助於提高覓食母生存價值的特性，與複製因子的特性是一樣的：長壽、生殖力和精確的複製能力。

3）但關於「精確的複製能力」：與基因傳播所具有的那種顆粒性的、全有或全無的遺傳特性大不相同，覓食母傳播受到連續發生的突變以及相互混合的影響（例如：所有篤信達爾文所說的人，並非都是完全拷貝達爾文本人的話，而是用自己的方式詮釋他的學說）

4）與基因「無目的」、「無意識」的「無私」與覓食母作類比：

5）覓食母和基因常常相互支持、相互加強，但它們有時也會發生矛盾

1）“囚徒博弈”

2）如何使得“零和博弈”轉化為“非零和博弈”

1）如果良性作用與不良作用同時發生於生物體中，其結果仍有助於整個身體。

2）如果對身體只有不良作用，而基因獨享好處，其結果對於生物體則是災

1）基因不僅只作用於自身個體，還可以對另一個生物體有延伸表型影響（吸蟲與蝸牛）

2）基因可能會離開某一個體身體，影響了其他個體的表型。 （「寄生去勢」）

3）「延伸表型」的中心法則：動物行為傾向於最大化指導此行為的基因的生存，無論這些基因是否在做出此行為的動物體內。 （布穀鳥）

1）複製因子是自然選擇的基礎單位，生死存亡的根本個體，連結了代代本質相同或隨機變異的複製血脈。

2）DNA分子便是複製因子，它們通常連接一起，形成較大的公共基因存留機器－「載體」（例如：我們的身體）

3）基因與個體生物分別以複製因子與載體的角色飾演不同角色，互相補充，同等重要

4)基因為何要選擇組成大型載體？ （細分為三個問題）

（1）曾經的某個時間點上，我們的祖先不如我們有腦子；

（2）在所有我們祖先的譜系中，一定有過「有腦子程度」方面的增長；

（3）這種成長是透過演化來實現的，可能還是由自然選擇推動的；

（4）無論是否是自然選擇推動的，至少表型方面的部分進化改變反映了深層的基因改變——發生了等位基因的替換，結果代際的精神能力平均水平提高了；

（5）人類群體一定曾經在「有腦子程度」方面有過顯著的基因變化，至少在遠古時期是這樣的。當時，有的人與同時代的人相比，基因上來講更聰明一些，有些人從基因上來講則相對要傻一些。

（1）時間滯後——我們今天所看到的動物很有可能是“過時的”，影響其建立過程的那些基因是在某個更早的時期為了應對與今天不同的條件而被選擇出來的。 （環境的改變有可能改變我們想要解釋的那個表型特徵的本性）

（2）歷史性限制－理論上可能會增強一個種系實現最優設計的可能性。由於缺乏遠見性，真正的自然選擇是一種反完美化的機制，

（3）可用的基因變化－動物得到的「基因」並非是最完美的設計。它是一系列歷史改變的產物，每一次改變最多也就是代表當時恰好是更好的那一個可選項

（4）成本與材料的限制－最好的設計是以最低的成本滿足指標要求（「滿足最低需求」）的方案。

（5）在一個層次上由於另一個層次的選擇作用所造成的不完美－一個個體選擇論者視為適應性的東西，可能在另一個類群選擇論者看來不完美

（6）由環境的不可預測性或「惡意性」所造成的錯誤－無論一種動物對環境適應得多好，這些環境條件也必須要看作一種統計意義上的平均水準。我們通常不可能在細節上處理每一個可以想像得到的意外事故。