銀河の最高権力者エクスターミネーターは、4人の黒曜石の将軍とともにインフィニティ・ストーンズの行方を探って回る。 エクスターミネーターが6つのインフィニティ・ストーンズを手に入れると、指を鳴らすだけで全宇宙の生命体の半分を完全に破壊することができる。
宇宙を守るため、トニー・スタークとスティーブ・ロジャースはそれぞれのアベンジャーズを再編成し、スパイダーマン、ドクター・ストレンジ、キング、ガーディアンズ・オブ・ギャラクシー、ブラックパンサー、ワカンダ王国とともに、何としてもエクスターミネーターのインフィニティ・ストーン収集を阻止しようと戦った。しかし、エクスターミネーターは最終的に6つのインフィニティ・ストーンをすべて集めることに成功し、全宇宙の生命の半分をランダムに消滅させた。
インフィニティ・ウォーの後、アベンジャーズはロケット・ラクーン、ネビュラ、キャプテン・マーベルの助けを借りて、ついにエクスターミネーターを見つけることに成功したが、エクスターミネーターはインフィニティ・ストーンをすべて破壊し、ソーは怒りのあまりエクスターミネーターを薙ぎ倒した。 しかし、宇宙はエクスターミネーターの行為によって荒廃したままだった。
5年後、量子界から帰還したアントマンが逆転の希望をもたらした。 生き残ったアベンジャーズは、エクスターミネーターの所業を覆し、宇宙に希望を取り戻し、生命を復活させるために再び集結する。結局、アイアンマンは壮絶な死を遂げるが、宇宙は見事に復活する。戦いの後、キャプテン・アメリカは正式にアベンジャーズを脱退し、代わりにファルコンにその地位と盾を譲る。