Галерея диаграмм связей Метаболизм и биологическое окисление
Это интеллект-карта метаболизма и биологического окисления, всего процесса материального и энергетического обмена между организмами и внешней средой. Включая все химические изменения, которые вещества претерпевают в живом организме, называемые обменом веществ.
Отредактировано в 2023-11-29 11:45:16Метаболизм и биологическое окисление
Метаболизм
концепция
Метаболизм:
Это весь процесс материального и энергетического обмена между организмами и внешней средой. Включая все химические изменения, которые вещества претерпевают в живом организме, называемые обменом веществ.
Катаболизм:
Распад питательных веществ на энергию и вещества, необходимые для обеспечения жизнедеятельности, называется катаболизмом.
Анаболизм:
Использование структурных элементов малых молекул или макромолекул и преобразование их в необходимые для себя макромолекулы называется анаболизмом, также известным как биосинтез.
Функция
Получать необходимые вещества из окружающей среды
Обеспечивают энергию, необходимую для жизнедеятельности организмов.
Преобразуйте материалы, полученные из внешнего мира, в структурные оригиналы собственного состава.
Сборка структурных элементов в макромолекулы, специфичные для организма.
Синтезировать или разлагать биомолекулы с различными специальными функциями в организмах.
основные принципы и правила
Метаболические процессы управляются серией ферментативных реакций в мягких условиях реакции.
Общий профиль метаболизма характеризуется: катаболизм сходится с образованием нескольких конечных продуктов, а анаболизм разветвляется с образованием множества продуктов.
Катаболический и анаболический пути одного и того же вещества не являются простыми обратимыми процессами, но существуют общие метаболические связи.
Различные метаболические пути локализованы в разных областях клетки.
Обмен веществ – это единство материального обмена и энергетического обмена. Преобразование и передача энергии осуществляются некоторыми универсальными носителями активации.
Обмен веществ регулируется
Основные метаболические пути различных организмов высоко консервативны.
Методы исследования
содержание
Определить структуру и функции ферментов и коферментов, участвующих в каждой метаболической реакции.
Определить структуру, названия и типы реакций субстратов, промежуточных метаболитов и конечных продуктов метаболического пути.
Определить механизм регуляции ферментативной реакции.
Материалы: дрозофила, крыса, мышь, морской еж, Xenopus, голубь, кролик, шимпанзе, хлорелла, кукуруза, Escherichia coli, Bacillus subtilis, Saccharomyces cerevisiae, красный пекарский фермент, тетрахимена, фаг Escherichia coli.
уровень
Исследования in vivo
Использование целых организмов, целых органов или групп микробных клеток и т. д.
исследование ex vivo
Использование срезов, гомогенатов или экстрактов органов и тканей.
метод:
метод отслеживания изотопов
ингибиторы ферментов
наследственные дефекты обмена веществ
ЯМР-спектроскопия
Метод измерения газа
Хроматография-масс-спектрометрия
Генная инженерия
Метаболомика и метаболомика
Геномика
Геном
Вся ДНК живых существ
транскриптом
Все РНК в организмах
Протеом
Все белки живых организмов
Метаболом
Все низкомолекулярные метаболиты организма в определенный физиологический период.
Методы исследования
Сбор проб, предварительная обработка проб, разделение и обнаружение метаболитов, предварительная обработка данных, анализ данных
биологическое окисление
основная концепция
концепция
Процесс окисления веществ в живых организмах называется биологическим окислением. В основном он относится к процессу, при котором энергия постепенно высвобождается при разложении сахара, жира, белка и т. д. в организме, и в конечном итоге образуются CO2 и H20.
этап
Сахара, липиды и белки расщепляются на основные строительные блоки (глюкозу, жирные кислоты, глицерин и аминокислоты). На этом этапе выделяется меньше энергии, менее 1% от общей энергии, и большая ее часть теряется в виде тепловой энергии.
Глюкоза, жирные кислоты, глицерин и аминокислоты подвергаются серии ферментативных реакций с образованием ацетил-КоА. Энергия, выделяющаяся на этом этапе, составляет около 1/3 всей энергии, часть которой запасается в высокоэнергетических химических соединениях.
Ацетил-КоА вступает в цикл трикарбоновых кислот и полностью окисляется с образованием СО2, а также подвергается четырем дегидрированиям одновременно: удаленный водород по дыхательной цепи передается кислороду с образованием воды, при этом выделяется большое количество энергии. время, часть которого сохраняется в АТФ для использования организмом.
Функции
Соблюдайте общие правила окислительно-восстановительных реакций (оксигенирование, дегидрирование, потеря электронов).
ферментативная реакция
Мягкие условия реакции (температура тела, pH, близкий к нейтральному)
Постепенная реакция, постепенное высвобождение энергии.
При образовании воды образуется АТФ (окислительное фосфорилирование).
дыхательная цепь
концепция
Ряд ферментов или коферментов на внутренней мембране митохондрий расположены в определенном порядке для переноса водорода или электронов, который называется цепью переноса электронов. Цепь переноса электронов связана с клеточным дыханием, поэтому ее еще называют дыхательной цепью.
Основные ингредиенты
Никотинамидадениндинуклеотид (НАД): кофермент различных дегидрогеназ, принимает 2H (2H 2e), удаленный от метаболитов, и передает его флавопротеину (FP).
Флавопротеин (ФП)
Простетическая группа: флавинмононуклеотид (ФМН).
Флавинадениндинуклеотид (ФАД)
Функция: катализирует дегидрирование метаболитов, а удаленный водород принимается FMN или FAD.
Железо-серный белок (Fe-S)
Содержащий атомы железа и атомы серы, он переносит по одному электрону за раз и представляет собой тело переноса одного электрона.
Железо-серные белки в основном существуют в комплексах с FP или цитохромом b.
Убихинон (UQ, Q)
Хинил, растворимый в жирах, боковая цепь содержит несколько единиц изопрена (Q10 млекопитающих). Единственный небелковый переносчик электронов в цепи переноса электронов.
цитохром
Белок с гемом в качестве простетической группы
Основные типы: а, а3, б, С, С1
бс, стр450
Заказ
Комплекс I (НАДН в убихинон)
НАДН: Q-оксидоредуктаза или НАДН-дегидрогеназа.
Флавопротеин (FMN), железо-серный белок
Функция: Водород, удаленный НАДН, переносится на Q через белки FMN и Fe-S в комплексе I (с переносом протона).
Комплекс II
сукцинатдегидрогеназа
Функция: Водород, удаленный янтарной кислотой, переносится на Q через белки FAD и Fe-S в комплексе II.
Комплекс III
Убихинон: цитохром с оксидоредуктаза
Цитохром bc, комплекс
В том числе: Fe-S, Cytb, Cytc,
Роль: перенос электронов из восстановленного Q в Cytc (с переносом протона).
Комплекс IV
цитохромоксидаза
В том числе: цитохром а, а3 и ферменты с ионами меди в качестве простетических групп.
Переносят электроны от цитохрома C к 1/2O2, активируют кислород с образованием O2- и, наконец, соединяются с 2H+ в митохондриальном матриксе с образованием H2O.
Синтез АТФ в митохондриях
СПС
Высокоэнергетические соединения, содержащие высокоэргические фосфатные связи.
Энергетические вещества, которые могут быть непосредственно использованы живыми организмами.
Как производится АТФ
Фосфорилирование на уровне субстрата: в сочетании с реакцией дегидрирования, процесс прямой передачи энергии в молекулах высокоэнергетических метаболитов на АДФ для генерации АТФ или ГТФ.
Когда высокоэнергетические соединения высвобождают энергию, они сопровождаются фосфорилированием АДФ с образованием АТФ. Независимость от переноса электронов в дыхательной цепи
Окислительное фосфорилирование: процесс сочетания фосфорилирования АДФ с образованием АТФ во время процесса переноса электронов в дыхательной цепи, также известный как связанное фосфорилирование.
Метаболиты окислительно дегидрируются и передаются кислороду через дыхательную цепь с образованием воды. В то же время высвобождается энергия, вызывающая фосфорилирование АДФ с образованием АТФ. Окисление и фосфорилирование связаны.
гипотеза хемиосмоса
Транспорт электронов внутренней мембраны митохондрий имеет функцию протонного насоса, способного вытеснять протоны со стороны матрикса наружу внутренней мембраны (комплексы I, III, IV).
Внутренняя мембрана митохондрий не позволяет протонам течь обратно, создавая электрохимический градиент (трансмембранный градиент протонов и градиент потенциала) внутри и снаружи мембраны.
Электрохимический градиент внутри и снаружи мембраны направляет протоны из специальных каналов обратно во внутренний матрикс мембраны. Трансмембранный процесс высвобождает энергию и запускает синтез АТФ (АТФ-синтаза).
регулировать
Скорость окислительного фосфорилирования в первую очередь регулируется энергетическими потребностями клетки (респираторный контроль).
Когда потребление АТФ увеличивается, концентрация АДФ повышается и окислительное фосфорилирование ускоряется.
Соотношение АТФ/АДФ является важным фактором регуляции скорости окислительного фосфорилирования.
Регуляция гормонов щитовидной железы
Гормон щитовидной железы активирует Na-K-АТФазу на клеточных мембранах различных тканей.
Больные гипертиреозом (гипертиреозом) имеют высокую скорость основного обмена.
ингибитор
ингибиторы дыхательной цепи
Блокируйте перенос электронов в определенном участке дыхательной цепи, чтобы препятствовать окислению.
Ингибитор АТФ-синтазы
Ингибирует синтез АТФ и влияет на перенос электронов в дыхательной цепи.
разобщающий агент
Разделите два сопряженных процесса транспорта электронов и образования АТФ, ингибируя только синтез АТФ, но не транспорт электронов.
немитохондриальные окислительные пути
система микросомального окисления
Монооксигеназная система (смешанно-функциональная оксидаза, гидроксилаза)
Один атом кислорода катализируемого О2 присоединяется к молекуле субстрата (гидроксилирование), а другой атом кислорода восстанавливается Н до Н2О (Н из НАДФН Н).
система пероксисомального окисления
Оксисосомы: обнаружены в печени, почках и клетках слизистой оболочки тонкого кишечника животных.
Содержит множество ферментов, катализирующих выработку H2O2, а также содержит ферменты, разлагающие H2O2.
Митохондриальные заболевания
Мутации митохондриальных генов
Митохондрии и активные формы кислорода
Митохондрии и апоптоз
Митохондрии и старение