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Galerie de cartes mentales Carte mentale biologie-transcription

Carte mentale biologie-transcription

Il s'agit d'une carte mentale sur la transcription biologique, y compris les eucaryotes, le traitement de l'ARN, les procaryotes, etc.

Modifié à 2023-11-24 11:58:40

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Transcrire

eucaryote

Enzymes⁄facteurs liés à la transcription

ARN polymérase

Pol I : grand gène précurseur de l'ARN ribosomal

Pol II : presque tous les gènes codant pour des protéines

Pol III : gènes d'ARNt, quelques petits gènes d'ARN nucléaire et gènes 5SrRNA

complexe protéique médiateur

Certaines sous-unités sont conservées de la levure à l'homme

Srb4\Med17 est presque nécessaire à la transcription intracellulaire de tous les gènes Pol II.

Pol Ⅱ facteur de transcription universel de protéine intermédiaire = Pol Ⅱ holoenzyme

Différents activateurs se lient à différentes sous-unités de la protéine intermédiaire pour amener la polymérase II à différents gènes. Régule la CTD kinase au sein de TFⅡH pour faciliter l'initiation de la transcription

Protéine régulatrice de l'ADN

Inclut souvent des enzymes modifiant la chromatine (nucléosome)

Phase d'initiation du facteur de transcription général GTF

processus de transcription

commencer

promoteur principal

Élément de reconnaissance TFIIB (BRE), élément TATA (boîte), codon d'initiation (Inr), élément promoteur en aval (DPE)

autres éléments de séquence

Éléments promoteurs proximaux, séquences activatrices en amont, amplificateurs, silencieux, éléments limites, isolants

formation du complexe de préinitiation

L'élément TATA du promoteur est reconnu par TFIIID et combiné en TBP, déformant l'ADN

La plateforme complexe TBP-ADN recrute d'autres facteurs de transcription généraux et polymérases, parmi lesquels TFⅡA, TFⅡBⅡ et TFⅡF avec la polymérase, suivis de TFⅡE, TFⅡH.

La phosphorylation de la polymérase se produit pendant la fuite du promoteur

étendre

Après la formation du complexe de préinitiation, le promoteur se déroule et entre dans la phase d'élongation

changement

Pol II élimine la plupart des facteurs d'initiation, tels que les facteurs de transcription généraux et les protéines médiatrices

Recrutez des facteurs d'élongation, tels que hSPT5, TFIIS (avec fonction de relecture), famille ELL (inhibe les pauses transitoires)

Résiliation

modèle de torpille

modèle allostérique

Traitement de l'ARN

Coiffage d'extrémité 5', épissage, polyadénylation d'extrémité 3'

Procaryotique

Enzymes/facteurs liés à la transcription

ARN polymérase

facteur d'initiation delta

processus de transcription

commencer

étape

La polymérase se lie initialement au promoteur pour former un complexe fermé

Un complexe fermé se transforme en complexe ouvert

Isomérisation, aucune hydrolyse de l'ATP requise

Deux changements structurels importants

La pince située à l'avant de la polymérase se fixe fermement sur l'ADN en aval.

Il y a un changement important dans la position de la région N-terminale de δ

Évasion du promoteur – initiation avortée

facteur d'initiation delta

Assure la liaison de la polymérase au promoteur, convertissant l'enzyme centrale en une forme qui initie uniquement la transcription au niveau du promoteur - holoenzyme ARN polymérase

L'élément UP n'est pas reconnu par les facteurs delta et fournit des interactions supplémentaires pour améliorer la liaison de la polymérase au promoteur.

La transcription est initiée par l'ARN polymérase, aucune amorce n'est requise et son interaction spécifique n'est spécifique que pour A.

étendre

polymérase d'élongation

Relecture pendant la composition

Fonction de relecture

Pyrophosphorylation

Hydrolyse

Résiliation

terminateur

Rho-indépendant

Également appelé terminateur intrinsèque

deux éléments de séquence

une courte séquence de répétition inversée

Environ 8 séquences de paires de bases A:T

Affecte de manière post-transcriptionnelle la polymérase, agissant sur l'ARN pour former une structure en épingle à cheveux qui détruit le complexe d'élongation

Rho-dépendant

Se lie à l'ARN simple brin lorsqu'il quitte la polymérase, a une activité ATPase et utilise l'énergie d'hydrolyse de l'ATP

spécificité

Site de liaison Rho (rut) spécifique

Impossible de se lier à une transcription en cours de traduction