（1）依R基團的結構分：脂肪族胺基酸、芳香族胺基酸、雜環胺基酸、雜環亞胺基酸

（2）依R基團的結構極性分：極性、非極性胺基酸

（3）依胺基酸的酸鹼性分：中性、酸性、鹼性胺基酸

（4）依營養狀況分：必需胺基酸和非必需胺基酸

物理性質：無色結晶，在晶體或溶液中以兩性離子狀態存在；熔點很高，旋光性不同 （除甘氨酸），吸收光譜有差異.......

吸收光譜：Trp、Tyr和Phe可吸收280nm附近的光，其他胺基酸不吸收可見光

兩性性質：胺基酸具有酸鹼性質，是一類兩性電解質

(1) 茚三酮反應

(2) 亞硝酸反應

(3) 二硝基氟苯反應（Sanger反應）

(4) 異硫氰酸苯酯反應（Edman反應）

(5) Dansyl-cl反應

作用力：次級鍵，包括氫鍵、疏水力、離子鍵、范德華力、配位鍵、酯鍵等

醯胺平面與勝肽單元

定義：多肽鏈主鏈由於氫鍵的作用而形成的空間排布（即主鏈本身的折疊和盤繞方式）

類型：α-螺旋、β-折疊、β-轉角、γ-轉角、無規捲曲

定義：指相互鄰近的二級結構單元（α-螺旋，β-折疊等）組合在一起，彼此相互靠近，形成在空間上能夠辨認、有規則的二級結構組合體

類型：αα，βxβ，β-曲折，β-折疊筒等

模體motif：指的是由2個或3個具有二級結構的勝肽段，在空間上相互接近，形成一個特殊的空間結構。

結構域domain：指在較大的球狀蛋白質分子或亞基中，其三維結構往往可以形成兩個或多個空間上可以明顯區別的區域，這種相對獨立的三維實體稱為結構域。

指在二級結構基礎上，多肽鏈再進一步折疊盤繞成更複雜的三維空間結構，主要靠非共價鍵（氫鍵、離子鍵、疏水鍵、二硫鍵）來維持。可理解為：二級結構單位集合組成三級結構

指寡聚蛋白中各次單元的立體排布和各亞基間的相互作用。可理解為蛋白質的亞基聚合成大分子蛋白質的方式（亞基是指寡聚蛋白中每一條具有三維結構的多肽鏈，是蛋白質分子的最小共價單位）。註：單鏈蛋白沒有四級結構。