Galerie de cartes mentales Carte mentale biologique des protéines
La structure tridimensionnelle d'une protéine fait référence à la position spatiale relative de tous les résidus d'acides aminés dans l'ensemble de la chaîne peptidique, c'est-à-dire la structure spatiale tridimensionnelle de l'ensemble de la chaîne peptidique.
Modifié à 2023-12-18 22:34:36Cent ans de solitude est le chef-d'œuvre de Gabriel Garcia Marquez. La lecture de ce livre commence par l'analyse des relations entre les personnages, qui se concentre sur la famille Buendía et raconte l'histoire de la prospérité et du déclin de la famille, de ses relations internes et de ses luttes politiques, de son métissage et de sa renaissance au cours d'une centaine d'années.
Cent ans de solitude est le chef-d'œuvre de Gabriel Garcia Marquez. La lecture de ce livre commence par l'analyse des relations entre les personnages, qui se concentre sur la famille Buendía et raconte l'histoire de la prospérité et du déclin de la famille, de ses relations internes et de ses luttes politiques, de son métissage et de sa renaissance au cours d'une centaine d'années.
La gestion de projet est le processus qui consiste à appliquer des connaissances, des compétences, des outils et des méthodologies spécialisés aux activités du projet afin que celui-ci puisse atteindre ou dépasser les exigences et les attentes fixées dans le cadre de ressources limitées. Ce diagramme fournit une vue d'ensemble des 8 composantes du processus de gestion de projet et peut être utilisé comme modèle générique.
Cent ans de solitude est le chef-d'œuvre de Gabriel Garcia Marquez. La lecture de ce livre commence par l'analyse des relations entre les personnages, qui se concentre sur la famille Buendía et raconte l'histoire de la prospérité et du déclin de la famille, de ses relations internes et de ses luttes politiques, de son métissage et de sa renaissance au cours d'une centaine d'années.
Cent ans de solitude est le chef-d'œuvre de Gabriel Garcia Marquez. La lecture de ce livre commence par l'analyse des relations entre les personnages, qui se concentre sur la famille Buendía et raconte l'histoire de la prospérité et du déclin de la famille, de ses relations internes et de ses luttes politiques, de son métissage et de sa renaissance au cours d'une centaine d'années.
La gestion de projet est le processus qui consiste à appliquer des connaissances, des compétences, des outils et des méthodologies spécialisés aux activités du projet afin que celui-ci puisse atteindre ou dépasser les exigences et les attentes fixées dans le cadre de ressources limitées. Ce diagramme fournit une vue d'ensemble des 8 composantes du processus de gestion de projet et peut être utilisé comme modèle générique.
structure tridimensionnelle des protéines
Aperçu
concept
structure ou conformation tridimensionnelle
la stabilité
Groupe peptidique/plan amide/plan peptidique
complot de Ramachadran
Sous-unités et monomères P128
Protéine oligomère, multimère, monomère
Protomère p128
Effet allostérique P134
Effet synergique
Synergie positive
synergie négative
effet idiosyncrasique
activateur
effecteur négatif (inhibiteur)
La conception des protéines est principalement déterminée par des interactions faibles
Interactions ioniques (paires d'ions et ponts salins), liaisons hydrogène, forces de Van der Waals et interactions hydrophobes
Les liaisons peptidiques ont des propriétés rigides et planes
Définition diagonale
structure secondaire des protéines
Définition (p100)
spirale p100
hélice alpha
sous-thème
structure()
angle dièdre
Raconter (comprendre)
Chiralité (primaire, main droite)
D-aa gaucher
L-aa droitier (le plus courant)
La séquence d'acides aminés affecte la stabilité de l'hélice alpha (5 points, p104)
Autres spirales
conformation β (-conformation) p104
définition
Feuille β (-feuille)
parallèle et antiparallèle
Brin/feuille β (-brin)
Tour β (-tour) ou structure en épingle à cheveux (structure en épingle à cheveux) p105
Structure tournante à 180°, impliquant 4 aa
résidus gly et pro
pourquoi
Tapez un et deux
boucle Ω
boucles aléatoires
Structure et domaines super secondaires
Super niveau 2
DéfinitionP114
sous-thème
Classification
αα
ββ
Feuille pliée anti-parallèle
Le plus simple : structure en épingle à cheveux β (structure en épingle à cheveux)
βαβ
bêta zigzag (-méandre) (clé grecque)
domaine
Définition p116
Parfois, des domaines fonctionnels
Raisons de l’apparition de domaines structurels
Caractéristiques et fonctions
la flexibilité
structure tertiaire
définition
Structure quaternaire
symétrie
4 types d'éléments de symétrie
Moteur des associations de niveau quatre
Force de Van der Waals, liaison hydrogène, liaison ionique, interaction hydrophobe
manière d'interagir
Spécificité de l'association de sous-unités
Fourni par l'hydrogène et les liaisons ioniques entre les groupes polaires sur les surfaces en interaction
Les avantages structurels et fonctionnels de l’association de quatrième niveau
Améliorer la stabilité structurelle
Améliorer l’économie et l’efficacité génétiques
Rassembler les groupes catalyseurs
A des effets synergiques et allostériques
Protéine membranaire
protéine de la membrane périphérique
protéine membranaire intrinsèque
premier type
Protéines membranaires avec un seul peptide transmembranaire
protéine membranaire avec sept peptides transmembranaires
Protéines membranaires β-baril - porines
Certains transporteurs et protéines de canal (p-p114)
Le transporteur de glucoseTransporteur de glucose
l'échangeur chlorure-bicarbonate
ATPases de transportATPases de transport
Canaux d'eau AquaporinesAquaporines
canaux ioniques
Protéine amphotrope/protéine ancrée dans les lipides
protéine globulaire
Caractéristiques structurelles tertiaires
Classification
toutes les protéines alpha
toutes les protéines β
protéine α/β
protéine alpha bêta
Protéines riches en métaux et disulfures
Protéine fibreuse p106
Caractéristiques
Les chaînes polypeptidiques sont disposées en longues lignes ou en feuilles et apparaissent fibreuses ou en forme de bâtonnets minces.
Généralement composée d'« un seul type de structure secondaire », la structure tertiaire est relativement simple
Classification
alpha-kératine
C'est une protéine structurelle de la peau et ses dérivés développés à partir de cellules ectodermiques.
spirale à gauche
Bonne évolutivité
protéine de feuille bêta
Fibroïne de soie
β-kératine
Collagène
Fibres de collagène
Procollagène
triple hélice
élastine
Repliement des protéines, dénaturation, prédiction de la structure
pli
Le repliement des protéines n'est pas une recherche aléatoire pour trouver la conformation d'énergie libre la plus basse
Méthodes pour étudier les intermédiaires
Le pliage s'effectue rapidement par étapes
Modèle de boule fondue
Le repliement de p141 implique les protéines isomérase et chaperon
PDI
IPP
transsexuel
Concept de transsexualité et de renaturation
Dénaturant
Mécanisme p135
Prédiction de structure
Méthodes de détermination des structures tridimensionnelles
Diffraction des rayons X
Pour la détermination de la structure cristalline
Résonance Magnétique Nucléaire RMN P94
Etude sur la structure dynamique des macromolécules biologiques
Changement chimique
microscopie électronique
Cryo-EM
microscopie électronique à coloration négative
Avantages et inconvénients (p-p198)
Conformation des protéines en solution
Spectroscopie de différence UV
Fluorescence et polarisation de fluorescence
Objectif p98
Dichroïsme circulaire p98
Objectif p-p218
dynamique des protéines
La structure secondaire régulière maintient les contours de la structure tertiaire et est en grande partie liée à l'activité biologique de la protéine. La plupart des parties les plus actives sont composées de « tours et boucles ».