Galerie de cartes mentales Chapitre 3 Chimie des protéines
Wu Guanghong Edition, la quatrième édition en 2021, comprend principalement des concepts de base, acides aminés, peptide, Protéine, etc. J'espère que cette carte mentale vous aidera !
Modifié à 2024-02-08 17:12:29Cent ans de solitude est le chef-d'œuvre de Gabriel Garcia Marquez. La lecture de ce livre commence par l'analyse des relations entre les personnages, qui se concentre sur la famille Buendía et raconte l'histoire de la prospérité et du déclin de la famille, de ses relations internes et de ses luttes politiques, de son métissage et de sa renaissance au cours d'une centaine d'années.
Cent ans de solitude est le chef-d'œuvre de Gabriel Garcia Marquez. La lecture de ce livre commence par l'analyse des relations entre les personnages, qui se concentre sur la famille Buendía et raconte l'histoire de la prospérité et du déclin de la famille, de ses relations internes et de ses luttes politiques, de son métissage et de sa renaissance au cours d'une centaine d'années.
La gestion de projet est le processus qui consiste à appliquer des connaissances, des compétences, des outils et des méthodologies spécialisés aux activités du projet afin que celui-ci puisse atteindre ou dépasser les exigences et les attentes fixées dans le cadre de ressources limitées. Ce diagramme fournit une vue d'ensemble des 8 composantes du processus de gestion de projet et peut être utilisé comme modèle générique.
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Chapitre 3 Chimie des protéines
concept de base
Protéine : un composé azoté de haut poids moléculaire composé d'acides aminés liés par des liaisons peptidiques
Composition élémentaire des protéines : principalement C, H, O, N, S
L'unité de base de la protéine : acide aminé (composé de 20 acides aminés)
Acides aminés : acides carboxyliques contenant des groupes aminés
acides aminés
Configuration : à l'exception de la glycine, les atomes de carbone α des autres acides aminés protéiques sont des atomes de carbone asymétriques.
Classification de 20 acides aminés courants
(1) Selon la structure du groupe R : acides aminés aliphatiques, acides aminés aromatiques, acides aminés hétérocycliques, acides imino hétérocycliques
(2) Selon la polarité structurale du groupe R : acides aminés polaires et non polaires
(3) Selon l'acidité et l'alcalinité des acides aminés : acides aminés neutres, acides et basiques
Acides aminés acides : acide aspartique, acide glutamique
Acides aminés basiques : arginine, lysine, histidine
Acides aminés neutres : autres
(4) Selon l'état nutritionnel : acides aminés essentiels et acides aminés non essentiels
propriétés importantes
Propriétés physiques : cristaux incolores, existant à l'état d'ions zwitterioniques dans des cristaux ou des solutions ; point de fusion très élevé, différentes rotations optiques (sauf la glycine), et différents spectres d'absorption...
Spectre d'absorption : Trp, Tyr et Phe peuvent absorber la lumière à près de 280 nm, les autres acides aminés n'absorbent pas la lumière visible
Propriétés amphotères : les acides aminés ont des propriétés acido-basiques et sont un type d'électrolytes amphotères.
pI : Lorsque la charge électrostatique d'un acide aminé est « nulle », la valeur du pH de la solution est appelée point isoélectrique de l'acide aminé, représenté par pI.
Lorsque le pH de la solution = pI, les acides aminés existent principalement sous forme zwittérionique
Lorsque le pH de la solution est < pI, les acides aminés existent principalement sous forme d'ions positifs.
Lorsque le pH de la solution est > pI, les acides aminés existent principalement sous forme d'ions négatifs.
Conseils pour calculer le point isoélectrique des acides aminés
Acide aminé neutre : pI=(pK1 pK2)/2
Acides aminés basiques : pI = (somme des deux plus grands pK) / 2
Acides aminés acides : pI = (somme des deux plus petits pK) / 2
réactions chimiques importantes
(1) Réaction à la ninhydrine
(2) Réaction à l'acide nitreux
(3) Réaction au dinitrofluorobenzène (réaction de Sanger)
(4) Réaction de l'isothiocyanate de phényle (réaction d'Edman)
(5) Réaction dansyl-cl
peptide
Définition : Un composé formé de deux ou plusieurs acides aminés liés par des liaisons peptidiques
protéine
Définition : Lorsque le poids moléculaire d'un polypeptide est suffisamment grand pour avoir une certaine structure spatiale, il peut être considéré comme une protéine.
Structure primaire (structure primaire) : fait référence à l'ordre des acides aminés dans la chaîne polypeptidique protéique. Les principales liaisons de connexion sont des liaisons peptidiques, et certaines liaisons disulfure existent également.
base de la structure spatiale
Force : liaisons secondaires, notamment les liaisons hydrogène, les forces hydrophobes, les liaisons ioniques, les forces de Van der Waals, les liaisons de coordination, les liaisons ester, etc.
Unité plan amide et peptide
structure secondaire
Définition : la disposition spatiale de la chaîne principale de la chaîne polypeptidique due à l'action des liaisons hydrogène (c'est-à-dire la façon dont la chaîne principale elle-même se plie et s'enroule)
Type : hélice α, feuille β, tour β, tour γ, bobine aléatoire
structure super secondaire
Définition : Désigne la combinaison d'unités structurelles secondaires adjacentes (hélice α, feuille β, etc.) et se rapprochant les unes des autres pour former un assemblage de structure secondaire spatialement identifiable et régulier.
Type : αα, βxβ, β-Zigzag, corps plissé β, etc.
Motif : fait référence à deux ou trois segments peptidiques avec des structures secondaires proches les unes des autres dans l'espace pour former une structure spatiale particulière.
Domaine structurel : fait référence à la structure tridimensionnelle de molécules ou sous-unités protéiques globulaires plus grandes qui peuvent souvent former deux ou plusieurs régions spatialement distinctes. Cette entité tridimensionnelle relativement indépendante est appelée domaine structurel.
structure tertiaire
Il fait référence à celui basé sur la structure secondaire, la chaîne polypeptidique est ensuite pliée et enroulée en une structure tridimensionnelle plus complexe, qui est principalement maintenue par des liaisons non covalentes (liaisons hydrogène, liaisons ioniques, liaisons hydrophobes, liaisons disulfure). Cela peut être compris comme suit : un ensemble d'unités de structure secondaires forme une structure tertiaire.
Structure quaternaire
Fait référence à la disposition tridimensionnelle des sous-unités dans les protéines oligomères et aux interactions entre les sous-unités. Cela peut être compris comme la manière dont les sous-unités protéiques se polymérisent en macromolécules (une sous-unité fait référence à chaque chaîne polypeptidique ayant une structure tridimensionnelle dans une protéine oligomère et est la plus petite unité covalente d'une molécule protéique). Remarque : les protéines à chaîne unique n'ont pas de structure quaternaire.
Protéines fibreuses et protéines globulaires : Si le rapport des axes moléculaires est supérieur à 10, il s'agit d'une protéine fibreuse, et s'il est inférieur à 10, il s'agit d'une protéine globulaire.
Focus : structure et fonction des protéines, relation entre structure et fonction, classification et propriétés des acides aminés