Galleria mappe mentale Introduzione alle proteine, lezione 2
La struttura quaternaria di una proteina si riferisce alla struttura tridimensionale presentata dalla polimerizzazione di ciascuna catena polipeptidica con una struttura terziaria in una molecola proteica multi-subunità in modo appropriato.
Modificato alle 2024-03-08 01:22:28Microbiologia medica, Infezioni batteriche e immunità riassume e organizza i punti di conoscenza per aiutare gli studenti a comprendere e ricordare. Studia in modo più efficiente!
La teoria cinetica dei gas rivela la natura microscopica dei fenomeni termici macroscopici e le leggi dei gas trovando la relazione tra quantità macroscopiche e quantità microscopiche. Dal punto di vista del movimento molecolare, vengono utilizzati metodi statistici per studiare le proprietà macroscopiche e modificare i modelli di movimento termico delle molecole di gas.
Este é um mapa mental sobre uma breve história do tempo. "Uma Breve História do Tempo" é um trabalho científico popular com influência de longo alcance. Ele não apenas introduz os conceitos básicos da cosmologia e da relatividade, mas também discute os buracos negros e a expansão. Do universo. questões científicas de ponta, como inflação e teoria das cordas.
Microbiologia medica, Infezioni batteriche e immunità riassume e organizza i punti di conoscenza per aiutare gli studenti a comprendere e ricordare. Studia in modo più efficiente!
La teoria cinetica dei gas rivela la natura microscopica dei fenomeni termici macroscopici e le leggi dei gas trovando la relazione tra quantità macroscopiche e quantità microscopiche. Dal punto di vista del movimento molecolare, vengono utilizzati metodi statistici per studiare le proprietà macroscopiche e modificare i modelli di movimento termico delle molecole di gas.
Este é um mapa mental sobre uma breve história do tempo. "Uma Breve História do Tempo" é um trabalho científico popular com influência de longo alcance. Ele não apenas introduz os conceitos básicos da cosmologia e da relatividade, mas também discute os buracos negros e a expansão. Do universo. questões científicas de ponta, como inflação e teoria das cordas.
Introduzione alle proteine, lezione 2
【Focus didattico】
struttura primaria delle proteine
La struttura primaria di una proteina si riferisce all'ordine dei residui amminoacidici nella catena polipeptidica della proteina, cioè alla sequenza amminoacidica.
Struttura primaria: *L'ordine degli aminoacidi nelle proteine *In una certa misura include anche altri componenti legati covalentemente
struttura primaria dell'insulina
Caratteristiche strutturali dell'ɑ-elica e del foglio β nella struttura spaziale.
spirale destra
Il legame idrogeno formato dal gruppo amminico e dal gruppo carbonilico è la forza principale che stabilizza l'elica.
3,6 aminoacidi per giro di elica
I gruppi di catene laterali si trovano all'esterno dell'elica
Diverse catene polipeptidiche sono disposte in direzioni anteriori o antiparallele
I gruppi amminici e carbonilici formano legami idrogeno intercatena
Le catene laterali si estendono sopra e sotto il telo
è la conformazione più estesa di una catena peptidica
Gruppi di catene laterali più piccoli avvicinano le catene peptidiche, il che è vantaggioso per la formazione dei foglietti β
1. Proposto da Pauling et al nel 1951, esiste sia nelle proteine fibrose che globulari. 2. La catena polipeptidica è piuttosto estesa, piegata in una struttura a zigzag tra unità peptidiche adiacenti (piani peptidici), e le catene laterali sono sfalsate sopra e sotto la struttura a zigzag - vedere struttura. 3. Più di due sezioni di questa struttura sono disposte in parallelo e le due catene possono essere parallele o antiparallele. 4. I legami idrogeno si formano tra le catene peptidiche tra le due catene per stabilizzare la struttura piegata. I legami idrogeno sono perpendicolari all'asse lungo dell'elica (antiparallelo). 5. La distanza tra amminoacidi adiacenti è 0,35 nm.
[Difficoltà nell'insegnamento]
Principi di determinazione della struttura primaria delle proteine
(1) Numero di catene polipeptidiche di molecole proteiche --- peso molecolare relativo
(2) Tipi di residui terminali di ciascuna catena peptidica: determinazione N-terminale e C-terminale
Determinazione degli aminoacidi N-terminali dei polipeptidi
Metodo Sanger (reazione del dinitrofluorobenzene)
Metodo DNS (reazione del dansil cloruro)
Metodo Edman (reazione dell'isotiocianato del benzene)
Metodo dell'aminopeptidasi
Determinazione dell'amminoacido C-terminale dei polipeptidi
Soluzione di idrazina
metodo di riduzione
metodo della carbossipeptidasi
(3) Sequenza di amminoacidi di ciascuna catena peptidica --- metodo di sovrapposizione
(4) Configurazione di legami disolfuro intra-catena o inter-catena, ecc.
La formazione della conformazione molecolare delle proteine
peptide
unità peptidica
I legami peptidici sono parzialmente doppi legami, con sei atomi in uno
struttura della catena peptidica
[Funzioni biologiche dei peptidi]
Innanzitutto, gli elementi strutturali delle proteine
Il secondo è che esistono sotto forma libera di peptidi per costituire sostanze fisiologicamente attive, collettivamente denominate peptidi bioattivi.
Tre come ormoni: ossitocina (9 peptidi), vasopressina (9 peptidi), calcitonina (32 peptidi), glucagone (29 peptidi), insulina (51 peptidi), ecc.
[Fonte di peptidi attivi]
1. Percorsi in vivo:
La maggior parte dei peptidi attivi nel corpo vengono elaborati da precursori proteici inattivi attraverso speciali sistemi enzimatici (come la scissione della catena polipeptidica, l'acilazione, l'acetilazione, ecc.)
2. Approccio in vitro:
Separazione e purificazione di peptidi attivi naturali (salatura, cromatografia, precipitazione selettiva, ecc.)
Preparazione di peptidi attivi attraverso sintesi chimica (possono essere utilizzati per la diagnosi clinica, il trattamento e la prevenzione di alcune importanti malattie)
Gerarchia della struttura delle proteine
struttura primaria
La struttura primaria di una proteina si riferisce all'ordine dei residui amminoacidici nella catena polipeptidica della proteina, cioè alla sequenza amminoacidica.
Struttura primaria: *L'ordine degli aminoacidi nelle proteine *In una certa misura include anche altri componenti legati covalentemente
struttura primaria dell'insulina
Struttura spaziale
struttura secondaria
La struttura secondaria di una proteina si riferisce alla conformazione spaziale locale degli atomi della spina dorsale di una catena polipeptidica. Si tratta di uno scheletro formato dalla disposizione ripetuta di tre atomi: N (azoto amminico), Ca (atomo di carbonio α) e Co (atomo di carbonio α). carbonio carbossilico); il gruppo R di ciascun residuo amminoacidico costituisce la catena laterale della catena polipeptidica. La struttura secondaria si riferisce alla conformazione degli atomi dello scheletro della catena principale e non coinvolge il gruppo R.
Struttura secondaria: *Struttura spaziale locale di un certo segmento peptidico in una molecola proteica *La struttura secondaria è principalmente la posizione spaziale relativa della catena principale della catena peptidica *Non comporta la conformazione dei gruppi di catene laterali degli aminoacidi
Principali tipi di strutture secondarie delle proteine
★α-elica: forma altamente avvolta, la più comune
Fattori che influenzano la formazione dell'α-elica 1. Troppi gruppi R con la stessa carica, come: Glu, Lys 2. Troppi gruppi R grandi, come: Leu, Ile, Asn 3. Interazioni tra gruppi R distanziati di 3-4 residui: *Legami ionici delle catene laterali acide e basiche *Interazioni idrofobiche tra catene laterali aromatiche 4.Pro non può formare α-elica: *Rigidità molecolare *L'atomo di N che forma il legame peptidico non ha H e non può formare legami idrogeno.
★lamiera β-plissettata: stato allungato, anch'esso relativamente comune
★β-turn (β-turn): la svolta nella catena peptidica
★Bobina casuale: uno stato senza caratteristiche strutturali specifiche
Superstruttura secondaria: motivo
Motivo: motivo/motivo/motivo
È composto da diverse unità strutturali secondarie, ma non può esistere indipendentemente dalla struttura complessiva della proteina.
Motivi specifici hanno sequenze di amminoacidi speciali e assumono funzioni speciali
*Proteina legante il DNA: motivo dito di zinco
*Calbindina: motivo di legame degli ioni calcio
struttura terziaria
La struttura terziaria di una proteina è la disposizione spaziale complessiva di tutti gli atomi dell'intera catena polipeptidica, ovvero sulla base della struttura secondaria si aggiunge l'interazione dei gruppi R della catena laterale e viene organizzata l'intera catena polipeptidica. struttura spaziale formata. In un ambiente acquatico, i gruppi polari si trovano spesso sulla superficie delle molecole proteiche, mentre i gruppi non polari si trovano spesso all'interno delle molecole proteiche.
Struttura terziaria: *La struttura spaziale complessiva della molecola proteica, inclusa la conformazione della catena principale e la conformazione della catena laterale Composto da diverse strutture secondarie *Può esistere in modo indipendente ed eseguire le sue funzioni
Fattori che mantengono la stabilità della struttura a tre livelli
legame covalente
legame disolfuro
chiave secondaria
legame idrogeno
legame ionico
interazione idrofobica
*La tendenza dei gruppi idrofobici ad aggregarsi tra loro in ambienti acquosi *Le molecole proteiche tendono a ripiegarsi in una forma globulare in soluzione acquosa, con gruppi idrofobi all'interno e gruppi idrofili all'esterno
Interazione di van derWaals
Struttura terziaria della mioglobina
*Prima proteina a chiarire la struttura terziaria *Contiene otto α-eliche, che rappresentano il 75%, e il resto sono spire e bobine casuali *La parte interna è un'area idrofobica, combinata con l'eme, mentre la parte esterna è costituita principalmente da gruppi idrofili
Mioglobina
dominio
★Dominio:
Una parte relativamente indipendente della struttura terziaria di una molecola proteica
Può esistere indipendentemente dal tutto ed eseguire le sue funzioni in modo indipendente
★Sintasi degli acidi grassi eucariotici: una catena polipeptidica contenente sei attività enzimatiche, ciascuna regione attiva dell'enzima ha una struttura terziaria indipendente
★Fibronectina: contiene sette domini funzionali indipendenti
Struttura quaternaria
Una proteina multimerica composta da più catene polipeptidiche. Ciascuna catena polipeptidica si ripiega per formare una propria struttura terziaria indipendente ed è associata insieme. Queste catene polipeptidiche che costituiscono la proteina multimerica sono le subunità della proteina. L'associazione tra le basi è la struttura quaternaria la proteina, compresa la disposizione spaziale e le interazioni delle subunità.
Struttura quaternaria: *Il modo in cui più catene polipeptidiche con strutture terziarie indipendenti si combinano tra loro per formare una proteina multimerica completa *Le catene polipeptidiche con strutture indipendenti sono chiamate subunità *L'associazione tra subunità avviene tramite legami secondari anziché legami covalenti