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Proteinbiologische Mindmap

Die dreidimensionale Struktur eines Proteins bezieht sich auf die relative räumliche Position aller Aminosäurereste in der gesamten Peptidkette, also auf die dreidimensionale räumliche Struktur der gesamten Peptidkette.

Edited at 2023-12-18 22:34:36

Deu-Martina

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dreidimensionale Struktur von Proteinen

Überblick

Konzept

dreidimensionale Struktur oder Konformation

Stabilität

Peptidgruppe/Amidebene/Peptidebene

Ramachadran-Handlung

Untereinheiten und Monomere P128

Oligomeres Protein, multimer, monomer

Protomer p128

Allosterischer Effekt P134

synergistischer Effekt

Positive Synergie

negative Synergie

eigenwillige Wirkung

Aktivator

negativer Effektor (Inhibitor)

Die Proteinkonzeption wird hauptsächlich durch schwache Wechselwirkungen bestimmt

Ionische Wechselwirkungen (Ionenpaare und Salzbrücken), Wasserstoffbrückenbindungen, Van-der-Waals-Kräfte und hydrophobe Wechselwirkungen

Peptidbindungen haben starre und planare Eigenschaften

Diagonaldefinition

Protein-Sekundärstruktur

Definition (S. 100)

Spirale S. 100

Alpha-Helix

Unterthema

Struktur()

Diederwinkel

Erzählen (verstehen)

Chiralität (primär, rechte Hand)

D-aa Linkshänder

L-aa Rechtshänder (am häufigsten)

Die Aminosäuresequenz beeinflusst die Stabilität der Alpha-Helix (5 Punkte, S. 104)

Andere Spiralen

β-Konformation (-Konformation) p104

Definition

β-Faltblatt (-Faltblatt)

parallel und antiparallel

β-Strang/Faltblatt (-Strang)

β-Turn (-turn) oder Haarnadelstruktur (Hairpin-Struktur) S. 105

180°-Drehstruktur mit 4 aa

Gly- und Pro-Rückstände

Warum

Geben Sie eins und zwei ein

Ω-Schleife

zufällige Locken

Supersekundäre Struktur und Domänen

Super Level 2

DefinitionP114

Unterthema

Einstufung

αα

ββ

Antiparallel gefaltetes Blatt

Die einfachste: β-Haarnadelstruktur (-Haarnadelstruktur)

βαβ

Beta Zickzack (-Mäander) (griechischer Schlüssel)

Domain

Definition S. 116

Manchmal funktionale Domänen

Gründe für das Auftreten struktureller Domänen

Eigenschaften und Funktionen

Flexibilität

Tertiärstruktur

Definition

Quartärstruktur

Symmetrie

4 Arten von Symmetrieelementen

Treibende Kraft für Verbände der Stufe 4

Van-der-Waals-Kräfte, Wasserstoffbrücken, Ionenbindungen, hydrophobe Wechselwirkungen

Art der Interaktion

Spezifität der Untereinheitsassoziation

Bereitgestellt durch Wasserstoff- und Ionenbindungen zwischen polaren Gruppen auf den interagierenden Oberflächen

Die strukturellen und funktionalen Vorteile der Assoziation der vierten Ebene

Verbessern Sie die strukturelle Stabilität

Verbessern Sie die genetische Ökonomie und Effizienz

Zusammenführung der katalytischen Gruppen

Hat synergistische und allosterische Wirkungen

Membranprotein

peripheres Membranprotein

intrinsisches Membranprotein

erster Typ

Membranproteine mit einem einzigen Transmembranpeptid

Membranprotein mit sieben Transmembranpeptiden

β-Barrel-Membranproteine – Porine

Einige Transporter und Kanalproteine (p-p114)

Der GlukosetransporterGlukosetransporter

der Chlorid-Bikarbonat-Austauscher

Transport-ATPasenTransport-ATPasen

Wasserkanäle AquaporineAquaporine

Ionenkanäle

Amphotropes Protein/lipidverankertes Protein

kugelförmiges Protein

Tertiäre Strukturmerkmale

Einstufung

Alles Alpha-Protein

Alles β-Protein

α/β-Protein

Alpha-Beta-Protein

Metall- und disulfidreiche Proteine

Faserprotein p106

Merkmale

Polypeptidketten sind in langen Linien oder Blättern angeordnet und haben ein faseriges oder dünnes stäbchenförmiges Aussehen.

Die Tertiärstruktur besteht im Allgemeinen aus „einer einzigen Art von Sekundärstruktur“ und ist relativ einfach

Einstufung

Alpha-Keratin

Es ist ein Strukturprotein der Haut und seine Derivate, die aus ektodermalen Zellen entwickelt werden.

linksdrehende Spirale

Gute Skalierbarkeit

Beta-Faltblatt-Protein

Seidenfibroin

β-Keratin

Kollagen

Kollagenfasern

Prokollagen

dreifach Helix

Elastin

Proteinfaltung, Denaturierung, Strukturvorhersage

falten

Bei der Proteinfaltung handelt es sich nicht um eine zufällige Suche nach der Konformation mit der niedrigsten freien Energie

Methoden zur Untersuchung von Zwischenstufen

Das Falten ist in Etappen schnell erledigt

Geschmolzenes Kugelmodell

An der Faltung von p141 sind Isomerase- und Chaperonproteine beteiligt

PDI

PPI

Transsexuelle

Transsexualitäts- und Renaturierungskonzept

Denaturierungsmittel

Mechanismus S. 135

Strukturvorhersage

Methoden zur Bestimmung dreidimensionaler Strukturen

Röntgenbeugung

Zur Bestimmung der Kristallstruktur

NMR Kernspinresonanz P94

Studie zur dynamischen Struktur biologischer Makromoleküle

chemische Verschiebung

Elektronenmikroskopie

Kryo-EM

Elektronenmikroskopie mit negativer Färbung

Vor- und Nachteile (S-S198)

Proteinkonformation in Lösung

UV-Differenzspektroskopie

Fluoreszenz und Fluoreszenzpolarisation

Zweck S. 98

Zirkulardichroismus S. 98

Zweck p-p218

Proteindynamik

Die reguläre Sekundärstruktur behält die Umrisse der Tertiärstruktur bei und hängt größtenteils mit der biologischen Aktivität des Proteins zusammen. Die meisten der aktiveren Teile bestehen aus „Kurven und Schleifen“.